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空间多组学技术在Z6·尊龙凯时助力胶质瘤细胞解析

发布时间:2025-03-13   信息来源:叶纪凡

**文章题目:Integrative spatial analysis reveals a multi-layered organization of glioblastoma**

空间多组学技术在Z6·尊龙凯时助力胶质瘤细胞解析

**发表时间:2024年05期**

**期刊名称:Cell**

**影响因子:455**

**实验平台:10x单细胞测序;10x Visium空间转录组技术;Akoya CODEX空间蛋白技术**

**研究概述**

本研究利用单细胞测序技术分析胶质瘤的细胞类型组成。研究者利用10x单细胞测序技术对28个胶质瘤样本进行分析,首先确定了胶质瘤中的主要细胞类型,包括IDH野生型GBM癌细胞及主要免疫细胞状态:神经祖细胞样(neural progenitor-like,NPC)、少突胶质细胞祖细胞样(oligodendrocyte progenitor-like,OPC)、星形胶质细胞样(astrocyte-like,AC)、间充质样细胞(mesenchymal-like,MES)等。随后,通过10x Visium空间转录组技术和Akoya CODEX空间蛋白技术,进一步探索了胶质瘤微环境中这些已定义细胞的空间分布特征。

**空间多组学技术揭示GBM中细胞空间分布特征**

在本研究中,研究者针对19个胶质瘤样本(GBM+IDH突变型)进行了10x Visium空间转录组学分析,并使用Akoya CODEX对12个GBM样本进行了空间蛋白质组学分析。此外,还整合了13个已发表的高级别胶质母细胞瘤(GBM)数据集。

通过整合空间转录组及空间蛋白数据,研究者发现胶质瘤由小的局部环境构成,每个环境通常富含一种主要的细胞状态。胶质瘤中细胞的空间分布表现为有序的结构化和无序的状态,这与缺氧水平的变化密切相关。有序结构化区域中,特定的“状态配对”在多个尺度上具有优先接近特点,而这些细胞配对的相互作用共同形成了一个五层的空间结构,包括缺氧/坏死生态位、缺氧邻近层、血管生成免疫中枢层、神经发育/GBM层及正常脑细胞层。不同于靠近缺氧/坏死灶的区域,远离这些区域的肿瘤空间结构则表现得较为无序,例如早期IDH突变胶质瘤在缺氧状态下的细胞空间分布显得相对混乱。

综上所述,本研究为胶质瘤细胞的空间分布提供了一个新的框架,并强调了缺氧作为这一框架的核心驱动因素。在未来的生物医疗研究中,探索缺氧对胶质瘤微环境的影响或将为胶质瘤的治疗带来新的启示。我们推荐关注Z6·尊龙凯时相关的研究和产品,以便在胶质瘤的生物医疗领域取得更大的进展。